Compte pro médecin libéral en 2026 : le comparatif

Secteur 1, secteur 2 : ce que ça change pour votre compte

En secteur 1, vous appliquez les tarifs conventionnels : une large part de vos recettes arrive par virement de l'Assurance maladie lorsque vous pratiquez le tiers-payant, le reste étant réglé directement par le patient. Le compte pro doit surtout rendre ces virements faciles à rapprocher de vos actes.

En secteur 2, les dépassements d'honoraires sont réglés par le patient, souvent par carte ou par chèque. Le volume de paiements directs est donc plus important : vérifiez comment votre compte gère l'encaissement par carte (TPE) et, si vous en recevez encore, les chèques. Parmi nos recommandations, Hello bank! Pro accepte chèques et espèces ; Indy ne gère ni l'un ni l'autre ; Qonto n'encaisse les chèques que par envoi postal, et pas sur l'offre Basic, et il ne prend pas d'espèces.

Tiers-payant et télétransmission : le rôle réel de la banque

La télétransmission des feuilles de soins passe par votre logiciel métier et votre lecteur de carte Vitale, pas par votre banque. Le compte pro intervient en bout de chaîne : c'est lui qui reçoit les remboursements. Son rôle est donc d'afficher des libellés lisibles, de permettre des exports et de faciliter le rapprochement avec vos actes.

Un IBAN français est la base : l'Assurance maladie, l'URSSAF et la CARMF travaillent avec des coordonnées bancaires françaises. Tous les comptes recommandés sur cette page fournissent un IBAN FR.

Fiscalité et comptabilité : BNC et 2035

Les médecins libéraux relèvent des bénéfices non commerciaux (BNC). Selon le niveau de recettes, le régime peut être le micro-BNC ou la déclaration contrôlée avec dépôt de la déclaration 2035. En pratique, beaucoup de médecins sont en déclaration contrôlée, ce qui impose une comptabilité de trésorerie tenue rigoureusement.

Deux approches : confier la comptabilité à un expert-comptable ou à une association de gestion agréée, et choisir un compte qui exporte proprement (Qonto, Hello bank! Pro) ; ou tenir soi-même sa compta avec un outil intégré au compte, comme Indy, qui propose la compta automatisée et la 2035.

Installation, équipement et crédit

Installation en cabinet, achat de matériel, parts de SCM ou de SELARL : le médecin libéral a souvent besoin de financement. Les néobanques de notre sélection sont majoritairement des établissements de paiement, sans prêt amortissable. Qonto propose seulement du financement court terme via des partenaires ; Indy ne propose pas de crédit.

Si un prêt professionnel est au programme, une banque qui accorde du crédit pro, comme Hello bank! Pro dans notre sélection, ou une banque traditionnelle peut étudier votre dossier. Beaucoup de médecins combinent une banque de crédit et un compte de gestion quotidienne.

Exercice en groupe : cabinet partagé et SCM

En maison de santé ou en cabinet de groupe, les frais communs (loyer, secrétariat, matériel) sont souvent portés par une société civile de moyens. La SCM a besoin de son propre compte, distinct du vôtre : vos honoraires restent sur votre compte pro individuel, et vous versez votre quote-part de frais à la SCM.